Apt update ошибка сегментирования

Внимание: apt-get -s не работает (ключик для проведения «мысленного эксперимента» вместо действия приводит к неадекватной оценке последствий).

Превышение числа пакетов

Если команда apt-get update завершается чем-то вроде:

Reading Package Lists... Error!
E: Dynamic MMap ran out of room
E: Error occured while processing ktechlab (UsePackage3)

или:

E: Wow, you exceeded the number of package names this APT is capable of.
E: Problem with MergeList /tmp/aptbox/var/lib/apt/lists/_ALT_Sisyphus_noarch_base_pkglist.classic
E: The package lists or status file could not be parsed or opened.

— скорее всего, apt’y приходится перелопачивать больше пакетов, чем дозволено лимитом (#16900).

Решение N1^[1]:

в /etc/apt/apt.conf добавить строку (если ещё нет):

APT::Cache-Limit <LimitInBytes>;

Где <LimitInBytes> — число большее, чем размер /var/lib/rpm/Packages в байтах.
Возможно, придётся подбирать Cache-Limit несколько раз, пока ошибка не исчезнет.

В apt 0.5.15lorg2-alt50 лимиты выставлены следующим образом (разница обусловлена предположением подключения biarch-репозитория):

• 83886080 (80M на 32-битных архитектурах);
• 100663296 (96M на 64-битных архитектурах).

Решение N2 (если в обновлённом apt это уже увеличили):

Обновить apt и libapt из соответствующего репозитория:

apt-get update -o APT::Cache-Limit=100663296
apt-get install apt

Объезд:

Отключить лишние репозитории в /etc/apt/sources.list.d/*.list и вновь отдать команду:

apt-get update

«Битые» пакеты

Если при обновлении системы или установке отдельных пакетов вываливается нечто вроде:

Committing changes...
Preparing...                 ###########################################  [100%]
1: some_package              error: unpacking of archive failed: cpio: Bad magic
E: Some errors occurred while running transaction

вероятней всего, rpm-архив (в данном случае «some_package») испорчен (получен не полностью).

Решение:

Отдать команды:

apt-get clean
apt-get install some_package

Ошибка обновления через rsync

Если при попытке обновления сведений о пакетах выходит ошибка с повторяющимися строками вроде приведённых ниже для apt-get update:

E: Программа обработки метода /usr/lib/apt/methods/rsync не найдена.
E: Tried to dequeue a fetching object

и для synaptic:

E: The method driver /usr/lib/apt/methods/rsync could not be found.

— то это означает, что в числе активных репозиториев есть подключенные через протокол rsync. Следует либо их отключить, либо доустановить пакет apt-rsync.

Ошибка сегментирования

Если при работе apt-get падает по Segmentation fault, удалите кэш apt:

mv /var/cache/apt/*pkgcache.bin /tmp

Если это поможет, и если примера в altbug #31089 ещё нет, приложите эти файлы к багу.

Проверьте stack лимиты, должно быть не менее:

# ulimit -s
8192

Задать можно тут:

/etc/security/limits.conf
root hard stack 8192
root soft stack 8192

Ругань о неудовлетворённых зависимостях при попытке сделать apt-get dist-upgrade

В таком случае надо сначала попытаться обновить отдельно apt и rpm, а потом повторить попытку dist-upgrade:

 apt-get install apt rpm
 apt-get dist-upgrade

Такое поведение не типичное, и случилось после того, как в строгие зависимости стали добавлять помимо name = epoch:version-release ещё и значение disttag (в rpm 4.0.4-alt128), а rpm до версии 4.13.0.1-alt6 не всегда справлялся с различением таких версий.

Удаление дубликатов пакетов (например, после прерванного dist-upgrade)

В пакете apt-scripts, начиная с версии 0.1.4-alt1, добавлена команда apt-get dedup, которая удаляет все непозволенные дубликаты из системы:

 apt-get install apt-scripts # если ещё не установлен
 apt-get dedup

Ссылки

I have a following minimalistic sources.list file:

root@c:~# cat /etc/apt/sources.list
deb http://ftp.fi.debian.org/debian/ wheezy main
root@c:~# apt-get update
Hit http://ftp.fi.debian.org wheezy Release.gpg
Hit http://ftp.fi.debian.org wheezy Release
Hit http://ftp.fi.debian.org wheezy/main i386 Packages
Hit http://ftp.fi.debian.org wheezy/main Translation-en
Reading package lists... Done
root@c:~# 

Now when I try to install a package, I end up with segmentation fault. For example:

root@c:~# apt-get install tcpdump
Reading package lists... Done
Building dependency tree       
Reading state information... Done
Segmentation fault
root@c:~#

In /var/log/messages there is a following entry logged:

Mar 29 05:46:25 c kernel: [ 4677.384747] apt-get[5607]: segfault at b8647e30 ip b8647e30 sp bfaaa9c8 error 14

The last (sp) number always changes, i.e if I execute apt-get install nmap three times, then following is logged:

Mar 29 05:46:59 c kernel: [ 4711.046400] apt-get[5612]: segfault at b86cbe30 ip b86cbe30 sp bfb36ea8 error 14
Mar 29 05:47:02 c kernel: [ 4714.229648] apt-get[5616]: segfault at b8609e30 ip b8609e30 sp bfcecec8 error 14
Mar 29 05:47:03 c kernel: [ 4715.505656] apt-get[5620]: segfault at b86dae30 ip b86dae30 sp bfb4b588 error 14

I have tried with different repositories and cleaned local repository of retrieved package files. What might cause segment fault when installing a package? Is my apt-get broken?

Вы не можете добавлять комментарии в эту тему. Тема перемещена в архив.

Не всегда программы в Linux запускаются как положено. Иногда, в силу разных причин программа вместо нормальной работы выдает ошибку. Но нам не нужна ошибка, нам нужна программа, вернее, та функция, которую она должна выполнять. Сегодня мы поговорим об одной из самых серьезных и непонятных ошибок. Это ошибка сегментации Ubuntu. Если такая ошибка происходит только один раз, то на нее можно не обращать внимания, но если это регулярное явление нужно что-то делать.

Конечно, случается эта проблема не только в Ubuntu, а во всех Linux дистрибутивах, поэтому наша инструкция будет актуальна для них тоже. Но сосредоточимся мы в основном на Ubuntu. Рассмотрим что такое ошибка сегментирования linux, почему она возникает, а также как с этим бороться и что делать.

Что такое ошибка сегментации?

Ошибка сегментации, Segmentation fault, или Segfault, или SIGSEGV в Ubuntu и других Unix подобных дистрибутивах, означает ошибку работы с памятью. Когда вы получаете эту ошибку, это значит, что срабатывает системный механизм защиты памяти, потому что программа попыталась получить доступ или записать данные в ту часть памяти, к которой у нее нет прав обращаться.

Чтобы понять почему так происходит, давайте рассмотрим как устроена работа с памятью в Linux, я попытаюсь все упростить, но приблизительно так оно и работает.

Допустим, в вашей системе есть 6 Гигабайт оперативной памяти, каждой программе нужно выделить определенную область, куда будет записана она сама, ее данные и новые данные, которые она будет создавать. Чтобы дать возможность каждой из запущенных программ использовать все шесть гигабайт памяти был придуман механизм виртуального адресного пространства. Создается виртуальное пространство очень большого размера, а из него уже выделяется по 6 Гб для каждой программы. Если интересно, это адресное пространство можно найти в файле /proc/kcore, только не вздумайте никуда его копировать.

Выделенное адресное пространство для программы называется сегментом. Как только программа попытается записать или прочитать данные не из своего сегмента, ядро отправит ей сигнал SIGSEGV и программа завершится с нашей ошибкой. Более того, каждый сегмент поделен на секции, в некоторые из них запись невозможна, другие нельзя выполнять, если программа и тут попытается сделать что-то запрещенное, мы опять получим ошибку сегментации Ubuntu.

Почему возникает ошибка сегментации?

И зачем бы это порядочной программе лезть, куда ей не положено? Да в принципе, незачем. Это происходит из-за ошибки при написании программ или несовместимых версиях библиотек и ПО. Часто эта ошибка встречается в программах на Си или C++. В этом языке программисты могут вручную работать с памятью, а язык со своей стороны не контролирует, чтобы они это делали правильно, поэтому одно неверное обращение к памяти может обрушить программу.

Почему может возникать эта ошибка при несовместимости библиотек? По той же причине — неверному обращению к памяти. Представим, что у нас есть библиотека linux (набор функций), в которой есть функция, которая выполняет определенную задачу. Для работы нашей функции нужны данные, поэтому при вызове ей нужно передать строку. Наша старая версия библиотеки ожидает, что длина строки будет до 256 символов. Но программа была обновлена формат записи поменялся, и теперь она передает библиотеке строку размером 512 символов. Если обновить программу, но оставить старую версию библиотеки, то при передаче такой строки 256 символов запишутся нормально в подготовленное место, а вот вторые 256 перезапишут данные программы, и возможно, попытаются выйти за пределы сегмента, тогда и будет ошибка сегментирования linux.

Что делать если возникла ошибка сегментирования?

Если вы думаете, что это ошибка в программе, то вам остается только отправить отчет об ошибке разработчикам. Но вы все-таки еще можете попытаться что-то сделать.

Например, если падает с ошибкой сегментации неизвестная программа, то мы можем решить что это вина разработчиков, но если с такой ошибкой падает chrome или firefox при запуске возникает вопрос, может мы делаем что-то не так? Ведь это уже хорошо протестированные программы.

Первое, что нужно сделать — это обновить систему до самой последней версии, возможно, был баг и его уже исправили, а может у вас установлены старые версии библиотек и обновление решит проблему. В Ubuntu это делается так:

sudo apt update
sudo apt full-upgrade

Если это не помогло, нужно обнулить настройки программы до значений по умолчанию, возможно, удалить кэш. Настройки программ в Linux обычно содержатся в домашней папке, скрытых подкаталогах с именем программы. Также, настройки и кэш могут содержаться в каталогах ~/.config и ~/.cache. Просто удалите папки программы и попробуйте снова ее запустить. Если и это не помогло, вы можете попробовать полностью удалить программу, а потом снова ее установить, возможно, какие-нибудь зависимости были повреждены:

sudo apt remove пакет_программы
sudo apt autoremove
sudo apt install пакет_программы

Если есть возможность, попробуйте установить программу из другого источника, например, не из PPA, а более старую версию, из официальных репозиториев.

Когда вы все это выполнили, скорее всего, проблема не в вашем дистрибутиве, а в самой программе. Нужно отправлять отчет разработчикам. В Ubuntu это можно сделать с помощью программы apport-bug. Обычно Ubuntu предлагает это сделать сразу, после того как программа завершилась с ошибкой сегментирования. Если же ошибка сегментирования Ubuntu встречается не в системной программе, то вам придется самим искать разработчиков и вручную описывать что произошло.

Чтобы помочь разработчикам решить проблему, недостаточно отправить им только сообщение что вы поймали Segmentation Fault, нужно подробно описать проблему, действия, которые вы выполняли перед этим, так чтобы разработчик мог их воспроизвести. Также, желательно прикрепить к отчету последние функции, которые вызывала программа (стек вызовов функций), это может очень сильно помочь разработчикам.

Рассмотрим, как его получить. Это не так уж сложно. Сначала запустите вашу программу, затем узнайте ее PID с помощью команды:

pgrep программа

Дальше запускаем отладчик gdb:

sudo gdb -q

Подключаемся к программе:

(gdb) attach ваш_pid

После подключения программа станет на паузу, продолжаем ее выполнение командой:

(gdb) continue

Затем вам осталось только вызвать ошибку:

И набрать команду, которая выведет стек последних вызовов:

(gdb) backtrace

Вывод этой команды и нужно отправлять разработчикам. Чтобы отключиться от программы и выйти наберите:

(gdb) detach
(gdb) quit

Дальше остается отправить отчет и ждать исправления ошибки. Если вы не уверены, что ошибка в программе, можете поспрашивать на форумах. Когда у вас есть стек вызовов, уже можно попытаться, если не понять в чем проблема, то попытаться узнать, не сталкивался ли с подобной проблемой еще кто-то.

Выводы

Теперь у вас есть приблизительный план действий, что нужно делать, когда появляется ошибка сегментирования сделан дамп памяти ubuntu. Если вы знаете другие способы решить эту проблему, напишите в комментариях!

Обнаружили ошибку в тексте? Сообщите мне об этом. Выделите текст с ошибкой и нажмите Ctrl+Enter.